在处理公司合规监督问题时，首先需要明确股权转让被查的原因。通常情况下，股权转让被查可能是因为以下原因：股权转让程序不符合法律法规要求、股权转让价格不合理、股权转让存在利益输送等。了解具体原因有助于针对性地解决问题。
二、审查股权转让协议
对于股权转让协议，应进行全面审查，确保其内容合法、合规。重点关注以下几个方面：股权转让双方的身份信息、股权转让价格、股权转让的支付方式、股权转让的生效条件等。如有不符之处，应及时修改或补充。
三、核实股权转让价格
股权转让价格是股权转让的核心问题。应核实股权转让价格是否公允，是否符合市场行情。如发现价格异常，应进一步调查原因，确保股权转让的合法性。
四、审查股权转让程序
股权转让程序是股权转让合法性的重要保障。应审查股权转让程序是否符合相关法律法规的要求，如股权转让的审批、备案等。如发现程序存在问题，应及时纠正。
五、关注关联交易
在股权转让过程中，可能存在关联交易。应关注关联交易是否符合法律法规的要求，是否存在利益输送。如发现关联交易存在问题，应及时调整或终止。
六、加强内部控制
公司应加强内部控制，建立健全股权转让的审批、监督机制。通过内部控制，确保股权转让的合法、合规进行。
七、加强员工培训
员工是公司合规监督的关键。应加强员工培训，提高员工对股权转让法律法规的认识，增强员工的合规意识。
八、寻求专业机构协助
在处理股权转让被查的合规监督问题时，如遇到困难，可寻求专业机构的协助。专业机构可提供法律、财务等方面的专业意见，帮助公司解决问题。
上海加喜财税公司服务见解：
上海加喜财税公司作为一家专业的公司转让平台，深知股权转让合规监督的重要性。我们建议，在处理股权转让被查的合规监督问题时，应首先从源头把控，确保股权转让协议的合法性和合规性。加强内部监督和员工培训，提高公司整体的合规意识。在遇到具体问题时，及时寻求专业机构的协助，确保公司能够顺利度过股权转让合规监督的难关。上海加喜财税公司提供全方位的股权转让服务，包括股权转让咨询、协议起草、价格评估等，助力企业合规发展。
