在林业公司土地转让协议书中，合同变更是指在协议签订后，由于各种原因，双方当事人对原合同内容进行修改或补充的行为。合同变更可能涉及转让价格、土地面积、使用年限、付款方式等多个方面。当合同变更发生时，如何处理已履行义务成为双方关注的焦点。
二、已履行义务的认定
在合同变更后，首先需要明确已履行义务的范围和内容。已履行义务包括但不限于以下方面：
1. 付款义务：根据原合同，买方已支付的部分款项。
2. 土地使用义务：买方已使用的土地面积。
3. 环保责任：买方在土地使用过程中已承担的环境保护责任。
4. 税费缴纳义务：买方已缴纳的相关税费。
5. 其他义务：根据原合同约定，买方已履行的其他义务。
三、合同变更后的处理原则
合同变更后，处理已履行义务应遵循以下原则：
1. 公平原则：在处理已履行义务时，应确保双方当事人的合法权益得到公平保护。
2. 诚信原则：双方当事人应本着诚信原则，积极协商，妥善处理合同变更后的已履行义务。
3. 合法原则：处理已履行义务的过程应符合法律法规的规定。
4. 实际原则：处理已履行义务应充分考虑实际情况，确保双方当事人利益最大化。
四、合同变更后的处理方式
1. 退还部分款项：若合同变更导致转让价格降低，买方有权要求退还部分已支付的款项。
2. 调整土地使用面积：若合同变更导致土地面积减少，买方有权要求调整土地使用面积。
3. 补偿环保责任：若合同变更导致买方承担的环保责任增加，卖方应给予相应补偿。
4. 补缴税费：若合同变更导致税费增加，买方应补缴相应税费。
5. 其他处理方式：根据合同变更的具体情况，双方当事人可协商确定其他处理方式。
五、合同变更后的争议解决
在合同变更后，若双方当事人对已履行义务的处理产生争议，可采取以下方式解决：
1. 协商解决：双方当事人应本着友好协商的原则，寻求争议解决方案。
2. 仲裁解决：若协商不成，双方当事人可申请仲裁机构进行仲裁。
3. 司法解决：若仲裁不成或双方当事人不愿仲裁，可向人民法院提起诉讼。
六、合同变更后的合同履行
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定继续履行合同义务。
七、合同变更后的档案管理
合同变更后，双方当事人应妥善保管变更后的合同文本及相关资料，以备日后查阅。
八、合同变更后的通知义务
合同变更后，双方当事人应及时通知对方，确保对方了解变更内容。
九、合同变更后的保密义务
合同变更后，双方当事人应继续履行保密义务，不得泄露对方商业秘密。
十、合同变更后的争议管辖
合同变更后，若发生争议，双方当事人应按照原合同约定的争议管辖条款解决。
十一、合同变更后的合同解除
在特殊情况下，合同变更可能导致合同解除，双方当事人应按照合同约定处理。
十二、合同变更后的合同终止
合同变更后，若合同目的已实现或无法实现，双方当事人可协商终止合同。
十三、合同变更后的合同续签
合同变更后，若双方当事人认为有必要，可协商续签合同。
十四、合同变更后的合同备案
合同变更后，双方当事人应按照法律法规的规定办理合同备案手续。
十五、合同变更后的合同履行期限
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定履行期限。
十六、合同变更后的合同履行地点
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定履行地点。
十七、合同变更后的合同履行方式
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定履行方式。
十八、合同变更后的合同履行主体
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定履行主体。
十九、合同变更后的合同履行标的
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定履行标的。
二十、合同变更后的合同履行费用
合同变更后，双方当事人应按照变更后的合同约定履行费用。
上海加喜财税公司（公司转让平台：https://www.zhuangongsi.cn）对林业公司土地转让协议书中的合同变更后如何处理已履行义务？服务见解：
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5. 协助双方当事人解决合同变更后的争议，维护双方合法权益。
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