一、明确债权债务范围
1. 在转让公司协议中，首先需要明确公司债权债务的具体范围。这包括但不限于公司的应收账款、预付款、应付账款、预收账款、长期借款、短期借款、对外投资、担保责任等。
2. 协议中应详细列出所有债权债务的具体信息，包括债务人的名称、金额、还款期限、利息等。
3. 明确债权债务的归属，即转让后，原公司债权人是否继续向新公司主张债权，原公司债务人是否继续向新公司履行债务。
二、债权债务的转让
1. 协议中应明确债权债务的转让方式，如直接转让、委托转让等。
2. 对于直接转让，协议中应明确转让的具体内容，包括债权债务的金额、期限、利息等。
3. 对于委托转让，协议中应明确委托人的权利和义务，以及受托人的权利和义务。
4. 协议中还应明确转让的生效时间，以及转让过程中可能产生的费用和责任。
三、债权债务的清理
1. 协议中应明确转让双方对债权债务的清理责任。
2. 对于原公司存在的债权，新公司应积极追讨，确保债权得到有效保障。
3. 对于原公司存在的债务，新公司应积极履行，避免因债务问题影响公司的正常运营。
4. 协议中应明确清理债权债务的期限，以及未能在规定期限内清理的后果。
四、债权债务的担保
1. 协议中应明确债权债务的担保方式，如抵押、质押、保证等。
2. 对于抵押和质押，协议中应明确抵押物或质押物的种类、价值、处置方式等。
3. 对于保证，协议中应明确保证人的资格、保证范围、保证期限等。
4. 协议中还应明确担保责任的承担方式，以及担保责任的解除条件。
五、债权债务的争议解决
1. 协议中应明确债权债务争议的解决方式，如协商、调解、仲裁、诉讼等。
2. 协议中应明确争议解决机构的选定，以及争议解决程序。
3. 协议中还应明确争议解决费用由谁承担，以及争议解决结果对双方的权利义务的影响。
六、债权债务的税务处理
1. 协议中应明确债权债务的税务处理方式，如增值税、企业所得税等。
2. 协议中应明确转让双方在税务处理上的责任和义务。
3. 协议中还应明确税务处理过程中可能产生的费用和责任。
七、债权债务的后续管理
1. 协议中应明确债权债务的后续管理责任，包括但不限于债务的催收、债权的维护等。
2. 协议中应明确后续管理过程中可能产生的费用和责任。
3. 协议中还应明确后续管理期限，以及未能在规定期限内完成后续管理的后果。
上海加喜财税公司见解：
在转让公司协议中处理公司债权债务，关键在于明确责任、保障权益、降低风险。上海加喜财税公司作为专业的公司转让平台，我们建议在协议中采取以下措施：
1. 详细列明债权债务信息，确保双方对债务情况有清晰的认识。
2. 明确转让双方在债权债务清理、担保、税务处理等方面的责任和义务。
3. 设立争议解决机制，确保在出现争议时能够及时、有效地解决。
4. 咨询专业律师，确保协议内容合法、合规。
通过以上措施，可以有效降低公司转让过程中的风险，保障双方的合法权益。上海加喜财税公司致力于为您提供专业、高效的公司转让服务，助力您的企业成功转型。
